HCPs監測是生物藥生產過程中的關鍵質量屬性（CQA），需要在開發和生產過程中對其存在進行監測、控制和記錄。而選擇合適的方法與可靠的試劑也十分關鍵。LC-MS方法分析HCPs的使用可以彌補HCP-ELISA方法的不足，如識別和量化單個HCP的能力，無需依賴抗HCP抗體。因此，該方法的應用及相應的監管要求在未來可能會增加。

LC-MS方法對生物藥物開發有諸多好處

1. 可確定原液中HCP，并比較GMP生產條件下的批間差異；

2. 可鑒定對患者安全和產品穩定性有潛在影響的特定種類HCPs；

3. 可用于評價純化過程中去除特定HCP的效果，例如高豐度的HCPs和潛在風險因子HCPs。

每個純化步驟后的HCP譜可以起到控制雜質清除的目的，并證明生產的一致性和穩健性。此外，LC-MS可以用于復雜生物藥物的蛋白雜質分析，如病*疫苗和基因治療產品。這類產品的工藝相關雜質來自多種生物體以及其他多種來源，包括人源細胞系、重組血清白蛋白、核*酶，以及制造過程中使用的其他酶等。

2017 年以來，有多家生物制藥公司已通過LC-MS方法分析各種蛋白質生物藥物中的HCP，包括單克隆抗體、疫苗和其他生物制劑。不同的品牌儀器，不同的數據庫軟件，不同的量化方法都能得到可靠的分析結果。

當選擇LC-MS作為生物制藥HCP分析方法時，無論是定量方法還是定性方法，都有必要進行適用性驗證。LC-MS方法分析HCP比較復雜，重現性非常重要。該方法由多個步驟組成，包括：蛋白變性、還原、烷基化、胰酶消化為肽段，肽段通過HPLC柱分離，并通過MS進行分析。樣品可能被消化為數千個肽段，產生數千張MS圖譜。因此，整合及在過程中建立內部控制品（QC）就至關重要，重復性和靈敏度也是質譜系統至關重要的參數。